软体动物牡蛎肌联蛋白一级结构的预测

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旨在预测牡蛎肌联蛋白的基因exon-intron结构,并确定其一级结构及结构域。利用生物信息学方法,从牡蛎基因组数据中预测肌联蛋白基因的exon-intron结构,并进一步预测编码肌联蛋白的m RNA组成,从而确定该蛋白的一级结构,并检测其结构域;与同源蛋白进行序列比对,制作系统进化树以了解其在系统进化中的位置。结果表明,该蛋白基因在基因组中横跨200 kb的序列区域,预测编码肌联蛋白的mRNA大约由74 kb组成,推测相对分子质量约为2 700 ku;该蛋白由Ig、Fn、kinase结构域,PEVK结构
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