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基于公共基因芯片的多农药代谢相关的拟南芥UGT基因挖掘

来源 :西北农业学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：william1212

【摘 要】

：

糖基转移酶1家族,也称尿苷二磷酸糖基转移酶(Uridine diphosphate glycosyltransferase,UGT),是植物解毒系统中最重要的多基因家族之一。该研究基于公共基因芯片数据对拟南芥

【作 者】

：

吴凡  贾晓晨  赵小明  尹恒 

【机 构】

：

中国科学院大连化学物理研究所,中国科学院大学

【出 处】

：

西北农业学报

【发表日期】

：

2019年1期

【关键词】

：

UGT 拟南芥 生物信息学分析 农药代谢 

【基金项目】

：

国家自然科学基金(31672077);国家重点研发计划(SQ2017ZY060073-02)~~

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糖基转移酶1家族,也称尿苷二磷酸糖基转移酶(Uridine diphosphate glycosyltransferase,UGT),是植物解毒系统中最重要的多基因家族之一。该研究基于公共基因芯片数据对拟南芥(Arabidopsis thaliana)的106个UGT基因进行生物信息学分析,期望找到参与广谱农药代谢的UGT靶标。从NCBI数据库收集并重注释关于农药和除草剂安全剂处理的基因芯片数据,差异表达分析和聚类分析表明8个UGT在绝大部分农药处理中均显著转录上调,是重要候选基因。基因本体论(Gene

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