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南通市疾病预防控制中心是2002年10月在原南通市卫生防疫站、市皮肤病防治所、市健康教育所三个法人单位基础上撤并组建的社会公益型事业单位，承担全市780万人口的卫生防病任务。主要职责为疾病预防控制、卫生监测检验、公共卫生技术管理与服务、预防医学教育与科研、健康教育与健康促进、皮肤病与性病诊治等。现有在职职工150余名，设有职能及业务科室20个。