KIR2DL1框架基因cDNA的分子克隆测序及一个新等位基因的鉴定

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目的

建立KIR2DL1框架基因cDNA的分子克隆测序方法,并鉴定南方汉族人群一个新的KIR2DL1等位基因。

方法

对一KIR2DL1框架基因测序分型结果异常的外周血样,提取mRNA,反转录为cDNA,用1对KIR2DL1框架基因特异性PCR引物进行扩增,特异性扩增产物(1.2 kb)经切胶回收纯化后,进行分子克隆和单倍型测序。

结果

KIR2DL1特异性PCR扩增产物,经分子克隆和单倍型测序,检出1个正常的KIR2DL1*00302等位基因和1个新变异的KIR2DL1等位基因。该新等位基因的序列与KIR2DL1*00302最相近,但存在编码区nt 188 A>G点突变、位于第4外显子的第42密码子由GAG变成GGG,导致第42位氨基酸残基发生Glu42Gly改变;其序列提交GenBank(序列号:KP025960)和IPD-KIR数据库(IWS40001982),已被世界卫生组织HLA因子命名委员会KIR分委会正式命名为KIR2DL1*031。

结论

我们建立了KIR2DL1框架基因cDNA分子克隆测序方法,在等位基因水平的KIR研究中具有广泛的应用前景。

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