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宏基因组学是分子生物学技术应用于微生物生态学研究而形成的一个新概念，以环境中未培养微生物为研究对象，通过直接从环境样品中提取全部微生物的DNA，构建宏基因组文库，利用基因组学策略研究环境样品所包含的全部微生物的遗传组成及其群落功能。从1998年提出至今，该项技术已经广泛应用于工业、农业、医学等研究领域。文章在对宏基因组学的概念、研究方法、存在问题的综述基础上提出了相应的解决方法，并指出该技术在环境保护和污染修复中存在潜在的应用价值。利用该技术可以深入了解特定环境中微生物空间分布和动态变化，为环境监测、预警