头颈部鳞状细胞癌中与p53突变相关基因的鉴定

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目的:探讨在头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)中与p53突变相关的潜在关键基因。方法:从GEO数据库中下载芯片数据GSE107591,用R语言加权重基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)包构建基因共表达网络并划分模块。选择与p53变异相关的基因模块进行GO分析和KEGG通路分析,并结合cytoscape筛选中枢基因。结果:基因共表达网络包括7个模块。其中蓝色(blue)模块与p53变异呈正相关,GO富集分析结果为细胞外基质组织
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