【摘 要】
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目的运用生物信息学技术分析胆道闭锁发生、发展的潜在生物学过程和关键基因。方法从公共数据库平台(GEO)下载胆道闭锁相关的基因芯片数据,运用R语言分析与胆道闭锁高度相关
【机 构】
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上海交通大学医学院附属仁济医院肝脏外科
【基金项目】
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上海市卫计委重中之重临床医学中心项目(2017ZZ01018),上海市申康三年行动计划(16CR1003A)
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目的运用生物信息学技术分析胆道闭锁发生、发展的潜在生物学过程和关键基因。方法从公共数据库平台(GEO)下载胆道闭锁相关的基因芯片数据,运用R语言分析与胆道闭锁高度相关的差异基因;对差异基因进行KEGG分析后,阐述其主要参与的信号通路。对差异基因构建蛋白质相互作用网络,从中筛选出主要的信息模块。同时,运用GSEA筛选出胆道闭锁中差异较显著的两条信号通路,富集出Core Enrichment Gene与主要模块中的基因做交集,检测不同基因对胆道闭锁诊断的准确度。结果一共筛选出了146个与胆道闭锁紧密相关的差异
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