目前，医学的分科越来越细，拿骨科为例，已经细分为创伤骨科、脊柱骨科、关节骨科、骨肿瘤以及手外科等，精准到了一个系统、一个器官，而专科医生也只看、甚至是只能看所在科室负责的某一系统或是某一器官的疾病，这就导致了问题的出现。
　　问题一：医生眼里患者成了器官
　　由于临床分科的不断细化，医生的整体，观念在不断消失，医生只知道自己学科的专门知识，只探求人体某一个局部的生理现象和病理变化。因此，前来就诊的患者在医生的眼里往往就变成了一个生了病的器官，医生只针对这一个器官进行治疗，但是有些局部病变却是全身疾病的局部表现，如果忽视了整体观念的话，就导致了一些患者的治疗效果并不明显。
　　问题二：“视触叩听”变成大堆检查单
　　很多人都有这样的体会，到医院去看病，很多医生听完患者的大概情况后就会先开出一堆化验单，让患者先去化验，出了结果才能诊断、开药治疗。以往医生为患者检查所用的“视触叩听”、“望闻问切”等基本功已经被严重忽视，而今往往只偏重于临床检验，有的医生甚至离了化验单就看不了病。专家指出，人是一个变化的、复杂的机体，拿癌症来说，有的患者查到了肿瘤标志物，但却不是癌症；有的患者虽然没查出肿瘤标志物，但患者确确实实得了癌症，这种情况时有发生。因此，疾病的诊治需要整体把握，如果一切从检验出发、按指标下药，这种治病的方法可能会好心办了“坏事”，出现误诊误治。
　　问题三：重视症状却忽视了整体分析
　　症状是疾病的表现，是反映疾病严重程度和进展转归的重要标志，不同的疾病可以表现为相同的症状，相同的疾病也可以表现为不同的症状，同一种疾病不同症状的出现顺序也不完全一样，有的疾病很严重但症状表现却很轻，所以说患者的疾病表现千差万别。
　　目前由于分科太细，很多医生对自己专科的疾病症状了如指掌，而对其他专科的疾病则不甚了解，看到相关症状就按自己专科的相应疾病治疗，却收不到良好的效果，这就是光看表面症状，却忽视了整体分析以及与其他学科疾病的鉴别导致的后果。
　　问题四：对“症”治疗而不是对“病”治疗
　　药是人类抗击疾病的重要“武器”，随着医学分科的细化，市场上的药物种类也越来越多。
　　目前，很多医生治疗疾病往往是针对症状下药，一个药物对应一种症状，效果不好就改用一个，甚至加用一个。有些患者由于用药数量较多，症状虽然消失了，但是不良反应却出现了。
　　问题五：对于疾病只重治疗而轻视预防
　　我国传统医学讲求“未病先防”，指出人类的健康应该以防病为主，但是现代医学在精细分科的过程中，对预防医学并没有引起足够重视。而随着医学的不断分化及微观化，“一个疾病、一种基因，一种病原，一种治疗”的线性思维模式成了医学发展的主流，临床医学主要解决的是发现一种疾病并进行治疗，基础医学主要是认识这种疾病，但并不能避免疾病在不同地区、不同人群的再次发生。预防医学则属于整合医学，需要整合流行病、劳动和环境卫生、基础医学、临床医学以及社会医学等等学科，来研究人类健康的影响因素及作用规律，制定公共卫生策略与措施来预防疾病的发生。但是由于目前医学分科越来越细，对全方位、多角度、全局性、大范围预防医学的发展造成了极大的影响。这种状态不解决的话，继续轻视预防，也许一个预防医生就可以完成的任务——防御疾病，将来会需要上百，甚至上千个临床医生才能完成——治疗疾病。
　　医学的分科越来越细，对医疗技术的发展和医生水平的提高确实具有非常大的促进作用，但是随着生活方式的改变和疾病谱的变化，学科的细分也给现代医学的发展带来了不少弊端，因此，专家指出，这一难题必须及早解决，必须呼唤整合医学的回归。