拟南芥盐胁迫响应启动子的生物信息学分析

来源 :山东农业大学学报(自然科学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:njg916
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本研究使用生物信息学方法分析了拟南芥盐胁迫响应的顺式作用元件。首先分析盐胁迫0.5 h、1 h的拟南芥全基因组芯片,得到627个盐胁迫上调基因和282个下调基因。然后使用MEME软件分析了盐胁迫响应基因的启动子,得到10个保守元件。通过显著性分布分析表明Motif_1/Motif_8/Motif_10显著分布于上调基因启动子中;Motif_1/Motif_10显著不分布于盐胁迫下调基因启动子中。Motif_1元件是G-box元件(ABRE(ABAResponsive Element)元件),大量分布于盐胁
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