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5G系统仿真中，由于多小区、多用户、多基站，多天线的大规模通信系统的出现，5G通信系统仿真的时间过长。为了突破5G仿真的“时间瓶颈”，本文将高性能GPU计算应用到大规模通信系统的仿真中，利用CPU和GPU的交互编程，完成仿真任务，并提升仿真效率。以信道系数从时域到频域的变换为例，对单个GPU和多GPU在通信系统仿真中的应用进行研究，得出了仿真性能提升的方法和提升效果。