一株新型鼠类星状病毒的基因组特点和进化分析

来源 :国际病毒学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:WOAILANTIAN112358
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的

研究一株新型鼠类星状病毒的基因组特点和进化关系。

方法

采集221只山东省鼠类肠道内容物,采用高通量测序方法进行病毒组研究。

结果

发现一株新型星状病毒,并获得该病毒接近全长基因组,命名为RoAstV/CHN/S3。RoAstV/CHN/S3具有典型的星状病毒基因组结构,相似性分析表明与啮齿类动物星状病毒和猪星状病毒4型关系最为相近。ORF2的氨基酸遗传距离结果显示,RoAstV/CHN/S3与啮齿类动物和猪星状病毒4型的遗传距离为0.557~0.655,哺乳星状病毒属内种之间的遗传距离为0.338~0.783,推断其可能为新种。根据ORF1a、ORF1b和ORF2的系统发育树结果,RoAstV/CHN/S3与啮齿类动物星状病毒、猪星状病毒4型聚为一簇,表明这些啮齿类动物星状病毒和猪星状病毒4型具有共同祖先,也提示潜在的祖先跨种传播。对221只鼠类的肠道内容物筛查结果显示,4只鼠类为阳性,阳性率为1.8%,其中3只为褐家鼠,1只为黑线姬鼠,均来自山东省济宁市。

结论

新型星状病毒RoAstV/CHN/S3的发现丰富了星状病毒的多样性,为新发突发传染病的防控提供了重要的数据信息。

其他文献
目的:建立一种实时荧光逆转录重组酶介导的等温扩增(reverse transcription recombinase-aided amplification,RT-RAA)技术检测寨卡病毒(Zika virus,ZIKV)的方法,以实现ZIKV的现场快
《工程测量》是辽宁生态工程职业学院工程测量技术专业一门专业核心课,课程教学改革一直在进行中,不断在尝试寻找更优的教学方式.《工程测量》课程参加了辽宁省教育厅举办的
目的:  观察并评价经抗菌肽 GL13K修饰后的纯钛表面对巨噬细胞 RAW264.7生存、形貌、炎性分泌功能及极化状态等的影响。  方法:  1.钛表面抗菌肽 GL13K修饰及理化性能检
目的:分析湖北省一起诺如病毒感染性腹泻暴发疫情的流行因素,为制定防控措施提供依据。方法:采用现场流行病学的方法进行调查,运用描述性流行病学方法、病例对照方法对调查数据
期刊
羊传染性脓疱病毒(orf virus,ORFV)是一种嗜上皮性病毒。近年来,随着对ORFV生物学特性、致病机制、抗肿瘤作用的深入研究,研究者发现ORFV是一个前景广阔的新型溶瘤候选病毒。优势
在社会不断发展的过程中,学前教育受到了更多人们的重视.其中,钢琴课是重要的学前教育课程,对于人才也具有较大的需求.在本文中,将就学前教育专业钢琴课教学现状与对策进行一
溃疡性结肠炎是一种慢性、复发性肠道炎症性疾病,常累及直肠、乙状结肠。由于糖皮质激素、免疫抑制剂、生物制剂的使用以及自身营养不良,导致患者极易发生机会性感染。巨细胞病毒作为一种机会致病病毒,在溃疡性结肠炎患者中较为常见。巨细胞病毒感染会加重患者病情,发生结肠切除及死亡的风险增加。为降低死亡率、改善预后,本文就溃疡性结肠炎与巨细胞病毒的关系及治疗策略做一综述,旨在为临床治疗提供参考。
新课改的不断渗透与优化给小学教育课程带来了巨大的变革.尤其是对于一些音乐、美术、科学等科目来说,新课改的要求,让这些科目变得尤为重要.在新课改的要求之下,小学美术课
我国是一个具有悠久诗歌传统的国家,作为一种相对独立文体的儿童诗歌,深受小学生的喜爱.小学语文教学中融入儿童诗歌教学,对激发学生学习兴趣,培养他们的观察能力和审美能力