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自20世纪初，小鼠的遗传学研究从宠物农场进入哈佛大学的实验室只有短短一百年的历史：但是，由于小鼠基因组与人类基因组高度同源、小鼠基因组改造手段非常成熟以及小鼠近交系、突变系和工具小鼠品系种类繁多，小鼠遗传学己成为发育生物学、功能基因组学和疾病机理研究的核心研究领域，小鼠也成为最重要的模式生物之一。近年来，随着小鼠基因组序列测序的完成，不同小鼠近交系品系特异的微卫星标记或单核苷酸多态性不断被发现，小鼠生理生化表型分析手段和数据也越来越完善，这些前期工作导致了目前大规模的基因剔除计划、基因突变计划及构建和分析