GEO基因表达数据库中芯片技术平台的统计分析

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基因芯片现已深入到生物学研究的多个方面,如表达谱分析、基因分型分析、比较基因组学分析、甲基化分析、ChIP-on-chip分析、微RNA分析等。基因芯片研究产生了海量的数据,由NCBI开发维护的GEO是最为知名的存贮和查询芯片数据的综合型数据库,存在多种多样的芯片技术平台。本文介绍GE0数据库中涉及的芯片技术平台、对其涉及物种、制造技术类型(cDNA芯片、寡核苷酸芯片等)、应用方向(mRNA、基因组DNA等)、供应商等进行了统计分析。
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