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大黄低效马尾松林区共有维管束植物63科、133属164种,其中被子植物54科121属151种;裸子植物3科5属6种;蕨类植物6科7属7种。属的分布区类型中,以热带分布占优势,而泛热带分布又在热带分布中占绝对优势。中国特有植物种类较多,占总种数的31.88%。属和种的配比特征为：较多的属含较少的种,较少的属含较多的种。植物区系起源古老,地理成分复杂多样。