版纳微型猪近交系PRPS2基因克隆、表达及生物信息学分析

来源 :农业生物技术学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lainfaye
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
酸核糖焦磷酸合成酶Ⅱ(phosphoribosylpyrophosphate synthetases 2,PRPS2),是生物体合成的关键酶,在控制肿瘤发生、促进细胞凋亡、抑制细胞增殖以及促进精子生成方面具有重要作用。为研究磷酸核糖焦磷酸合成酶Ⅱ基因(PRPS2)在猪(Sus scrofa)雄性不育方面的作用及基因编码的蛋白质功能,从Gen Bank下载猪及近缘物种的PRPS2 m RNA序列作为参考序列,设计特异引物扩增版纳微型猪近交系(Banna mini-pig inbred line,BMI)PRPS2基因,应用q RT-PCR分析15个重要组织的m RNA表达谱,并对蛋白质序列进行功能生物信息学分析。研究获得了BMI PRPS2 1 282 bp的c DNA序列(Gen Bank登录号:KU705637,对应的氨基酸登录号:AOC89055),编码318个氨基酸。组织表达谱显示,PRPS2基因在精囊腺中呈现高表达水平,在其他14个组织中呈现中低表达水平。生物信息学分析表明,PRPS2蛋白分子量(Mw)为34.83 k D,等电点(p I)为6.15,存在2个保守结构域,无跨膜结构,无信号肽序列,N末端和C末端疏水,有4类功能活性位点,位于细胞质的概率是89%;PRPS2基因在进化中高度保守。该研究结果将为进一步研究PRPS2基因在猪雄性不育方面的作用及功能提供参考。 Phosphoribosylpyrophosphate synthetases 2 (PRPS2), a key enzyme in biosynthesis, play an important role in controlling tumorigenesis, promoting apoptosis, inhibiting cell proliferation and promoting spermatogenesis. PRPS2 m RNA sequence of porcine and related species was downloaded as a reference sequence from GenBank to investigate the role of PRPS2 in male sterility of pig (Sus scrofa) and the function of the protein encoded by the gene. Primers were designed to amplify the PRPS2 gene of Banna mini-pig inbred line (BMI). QRT-PCR was used to analyze the m RNA expression profile of 15 important tissues and functional bioinformatics analysis of the protein sequence . The cDNA sequence of 1 282 bp of BMI PRPS2 was obtained (Gen Bank accession number: KU705637, the corresponding amino acid accession number: AOC89055), which encoded 318 amino acids. Tissue expression profiles showed that the PRPS2 gene was highly expressed in seminal vesicles, and showed low and intermediate expression levels in the other 14 tissues. Bioinformatics analysis showed that the PRPS2 protein has a molecular weight (Mw) of 34.83 kD and an isoelectric point (pi) of 6.15. There are two conserved domains, no transmembrane structure, no signal peptide sequence, N-terminal and C-terminal hydrophobic , There are 4 types of functional active sites, the probability of being located in the cytoplasm is 89%; PRPS2 gene is highly conserved in evolution. The results of this study will provide reference for further study on the role and function of PRPS2 gene in male sterility of pigs.
其他文献
引言  区域创新体系英文表述为Regional Innovation Systems(简称RIS)。英国卡迪夫大学的库克( Philip Nicholas Cooke,1992) 教授首先提出了"区域创新体系"的概念,他将RIS定义为"主要是由在地理上相互分工与关联的生产企业、研究机构和高等教育机构等构成的区域性组织系统,该系统支持并产生创新"。旅游产业集群是围绕特定区域的旅游吸引物形成的旅游核心
目的分析光气中毒的临床表现及胸部X线特征。总结不同程度急性光气中毒的临床特点以及治疗、转归。方法对23例光气中毒患者的临床资料做回顾性分析,根据轻、中、重度光气中毒
为政重在廉,管党务必严。习近平总书记指出:“反对腐败、建设廉洁政治,保持党的肌体健康,始终是我们党一贯坚持的鲜明政治立场。”近期,山西连续出现的严重腐败案件,究其根本
印染行业是工业废水排放大户,其水质变化十分复杂,污染物主要是织物的夹带和加工过程中所用的染料、化学助剂等。印染废水因水量大、有机物浓度高、色度深、碱性大、水质水
为了解新疆南疆地区鸡戊型肝炎病毒(HEV)的感染情况,采用酶联免疫吸附试验对采自新疆南疆家禽屠宰场、规模化养鸡场和散养农户的1 800份鸡血清进行了戊型肝炎病毒IgG和Ig M抗
为了探究meq基因缺失的马立克氏病毒疫苗株SC9-1与超强毒株Md5是否能够通过自然重组获得meq基因的能力,将SC9-1疫苗毒和Md5超强毒共同感染鸡胚成纤维细胞(CEF),并在CEF上连续
党的建设制度的改革,是经济体制、政治体制、文化体制、社会体制、生态文明体制改革的根本保证。党的十八届三中全会《决定》提出:“深化党的建设制度改革”。这是对马克思主
为研究育肥方式对滇南小耳猪脂肪酸含量的影响以生产优质猪肉,按规模化养殖、“吊架子”和“全放养加补饲”等3种育肥方式进行滇南小耳猪育肥试验,测定其背最长肌、背脂、腹
2004年1月9日,香港公开大学校长、中国科学院院士梁智仁教授率副校长黄锡楠教授、商业管理学院院长叶耀强教授、中国事务统筹主任许声浪一行4人,专程访问深圳信息职业技术学
职务犯罪中渎职犯罪与贿赂犯罪相交织与侦查权"以罪名配置"的矛盾、职务犯罪主体群体化特征凸显与办案力量分散的矛盾、职务犯罪行业性特征突出与侦查权"非专业分类"的矛盾,