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【目的】核桃腐烂病已成为制约新疆核桃产业健康发展的重要病害之一,筛选拮抗菌株开展该病害的生物防治,有利于新疆生态健康果园的建设。【方法】采用平板分离、对峙培养、致畸菌丝形态观察、拮抗菌形态学、生理生化特性及分子生物学的鉴定方法。【结果】获得具有广谱拮抗效果的拮抗菌株XJAU-117,对核桃树腐烂病病原菌的拮抗效果达85%。通过形态学观察、生理生化特性和16s r DNA序列分析,鉴定为短小芽孢杆菌（Bacillus pumilus）,拮抗菌株对核桃树腐烂病病原菌的抑制机理主要为使正常菌丝发生断裂、解体,无