基于目的基因捕获的高通量测序技术在遗传代谢病诊断中的应用

来源 :中华实用儿科临床杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:johnchen1001
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目的

探讨基于目的基因捕获的高通量测序技术对串联质谱联合气相色谱-质谱技术在遗传代谢病(IMD)诊断中的应用价值。

方法

收集中山大学附属第六医院遗传代谢病实验室通过串联质谱联合气相色谱-质谱技术检测的疑似阳性10例患儿及其父母外周血样本,通过包含有153个常见的IMD致病基因捕获探针的高通量测序技术对患儿进行基因检测,采用Sanger测序技术对患儿阳性突变位点进行验证,并对其父母相应的位点进行检测。

结果

10例疑似IMD患儿,通过高通量测序技术确诊8例,包括全羧化酶合成酶缺陷症3例,甲基丙二酸血症mut型、甲基丙二酸血症cblB型、枫糖尿症Ⅰa型、鸟氨酸氨甲酰转移酶缺乏症、Citrin缺陷症各1例。其中有1例经串联质谱联合气相色谱-质谱诊断为异戊酸血症的患儿,其基因检测发现1个错义突变(c.158G>C,p.R53P)和1个同义突变(c.732C>T,p.D244D);另外1例疑诊为Citrin缺陷症的患儿,其基因检测发现1个错义突变(c.1156G>A,p.G386S)和1个同义突变(c.1194A>G,p.L398L),这2例基因检测结果在理论上尚不能确诊。10例患儿中鸟氨酸氨甲酰转移酶缺乏症患儿的致病突变属于自身新发生的基因突变,而其他患儿的致病突变均遗传于各自的父母。此外,高通量测序所检测的结果均经Sanger测序验证,二者结果全部一致。

结论

基于目的基因捕获的高通量测序技术在疑似IMD的检测中结果精确,不仅可为临床医师提供可靠的分子诊断依据,还能精准地进行疾病分型,有效地为后续临床治疗和遗传咨询提供依据。

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