【摘 要】
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该研究从NCBI网站下载油棕全基因组序列信息,从The Arabidopsis Information Resource(TAIR)数据库中下载得到拟南芥WRKY转录因子序列,并在油棕基因组数据库中进行BLAST同源
【机 构】
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中国热带农业科学院椰子研究所/海南省热带油料作物生物学重点实验室
【基金项目】
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农业农村部物种品种资源保护费项目(125163015000160004);热带木本油料产业技术创新团队项目(17CXTD-13);农业农村部农业国际交流与合作项目(SYZ2019-12);国家自然科学基金(31601723)
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该研究从NCBI网站下载油棕全基因组序列信息,从The Arabidopsis Information Resource(TAIR)数据库中下载得到拟南芥WRKY转录因子序列,并在油棕基因组数据库中进行BLAST同源序列比对分析,通过NCBI在线工具CDD和PFAM数据库进行蛋白结构与分析,剔除无WRKY结构域的系列,利用生物信息学方法对油棕WRKY转录因子进行分析及功能预测。结果表明:(1)从油棕基因组数据库中发掘WRKY转录因子95个,该WRKY转录因子蛋白质所编码氨基酸大小为116~1303 bp,
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