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本文基于非参数方法双产出模型，将大豆生产资源配置效率分解为规模效率、纯技术效率和要素可处置度，在分析转型期中国大豆生产资源配置效率的基础上进一步研究其结构优化策略。结果表明，制约中国大豆生产资源配置效率的因素是生产规模效率。因此，中央政府应加大力度保护和提高各大流域耕地资源利用效率，抑制长江流域大豆低效生产状况，提高松辽、黄河流域大豆生产资源配置效率。具体措施包括，一是不断完善农地和农业人口政策，二是促进技术的创新与科技成果转化，三是实施粮食直接补贴政策，四是进行经济调控。