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利用3对叶绿体基因片段（psbJ-petA，psbA-trnH和trnS-G）和1对线粒体基因片段（nad7内含子2）对桂花品种群进行了初步研究，结果表明：4对基因片段都有一定的分辨率，其中trnS-G和nad7内含子2具有较多的信息位点，有潜力成为桂花种下等级鉴定的DNA条形码；桂花与其近缘种的分子系统树结果与经典分类基本一致，支持木犀属各组的划分；桂花品种起源很有可能存在种间或种内的基因交流，不是单物种起源，这或许与桂花雄全异株的繁育系统有关。