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位于毛囊中的黑素干细胞在人和动物的皮肤附件系统中起着黑素细胞储存库的作用。在哺乳动物，黑素干细胞负责向毛母质提供黑素细胞，活化的黑素细胞向毛干的角质形成细胞提供黑素。在人类，黑素干细胞一方面可为毛母质提供黑素细胞，如生长期毛母质中的黑素细胞、斑秃毛发再生中毛母质的黑素细胞等；另一方面可为脱色的表皮提供黑素细胞，如白癜风复色、表皮烧伤或擦伤后的复色。所以，对毛囊黑素干细胞的深入理解在研究色素变化和相关疾病方面具有重要的意义。