杭州市急性呼吸道感染婴幼儿中副流感病毒3型遗传进化及其感染特征研究

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目的

分析杭州市婴幼儿中副流感病毒3型(HPIV-3)的遗传进化及其感染与合并感染情况。

方法

收集2009年12月至2013年3月杭州地区医院0~11岁婴幼儿急性呼吸道感染病例咽拭子或呼吸道吸出物样本,共856份(男性553例,女性303例)。采用逆转录荧光定量PCR(qRT-PCR)法检测HPIV-3,阳性样本用特异性引物扩增HN基因进行基因测序,将测序所得序列用Clustal X 2.0软件进行比对,然后使用MEGA 6.0软件,采用邻接法建立系统进化树。同时,用qRT-PCR法检测与其他呼吸道病原体的合并感染情况。采用χ2检验比较不同特征患儿单一感染与合并感染情况。

结果

856例患儿中,HPIV-3阳性84例(9.6%)。男性患儿HPIV-3感染阳性率为10.0%(55/553),女性患儿阳性率为9.6%(29/303)(χ2=0.03,P=0.860)。84例HPIV-3阳性病例的合并感染率为49%(41例),其中与鼻病毒合并感染检出率较高,为41%(17例);1岁以下患儿的合并感染率为54%(36/67),高于单一感染率[46%(31/67)](χ2=4.78,P=0.029);单一感染患儿伴有肺炎症状占93%(37/40),高于合并感染组[76%(29/38)](χ2=3.92,P=0.048)。同源性分析结果显示,56例患儿HPIV-3的HN基因编码区核苷酸和氨基酸序列一致性均较高,一致性分别为96.9%~100.0%和98.6%~100%。基于HN基因的进化树分析表明,杭州株均归属于C3亚群。

结论

杭州市婴幼儿的急性呼吸道感染与HPIV-3有关;HPIV-3 HN基因型变异较小,但进化具有一定地域特征;与其他呼吸道病毒的合并感染率较高。

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