【摘 要】
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目的 应用基因芯片对临床常见的8种致病细菌进行检测.方法 选取8种临床常见的致病细菌,包括金黄色葡萄球菌、铜绿假单胞菌、肺炎克雷伯菌、大肠杆菌、奇异变形杆菌、产气肠杆
【机 构】
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广州阳普医疗科技股份有限公司,武汉大学中南医院基因诊断中心
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目的 应用基因芯片对临床常见的8种致病细菌进行检测.方法 选取8种临床常见的致病细菌,包括金黄色葡萄球菌、铜绿假单胞菌、肺炎克雷伯菌、大肠杆菌、奇异变形杆菌、产气肠杆菌、荧光假单胞菌、宋内志贺菌.以16S rRNA基因为目的基因,白行设计通用引物系列扩增目的片段,针对高变区域设计探针,建立基因芯片检测体系,并对所选细菌进行检测.收集来自武汉大学中南医院的待检标本50份,包括血液6份、痰液32份、粪便9份、纤维支气管镜检测物3份,提取DNA后利用建立的基因芯片进行检测.结果 自行设计的通用引物能很好地扩增目的片段,针对8种细菌进行多批次重复检测,结果显示所选用的探针具有很好的检测效果.对临床50份标本进行检测,其中47份得到准确的检测结果,3份未得到结果的原因为芯片未包含菌种.通过优化检测过程,可在8h内报告检测结果.探针信号随时间的衰减程度观察表明,60d后探针信号虽有衰减,但其衰减程度对检测结果判断无影响.结论 本研究设计的基因芯片检测体系能准确而快速地对临床常见细菌做出检测,为基因芯片技术应用于临床奠定基础.
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