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人类肠道微生物群落被认为是人类的"第二指纹"及"第二基因组"[1],微生物的基因组数量是人类基因组的150多倍,这些微生物构成人体的一个独立器官,参与机体的代谢,并与各器官之间相互关联,对人类健康具有深远影响[2-3].如何定义复杂的微生物生态系统,通过研究技术的不断进步来探索它们的作用是21世纪微生物学中重要的研究计划.长期以来,研究肠道菌落一直是依靠细菌培养,然而,在人类肠道中,绝大部分种类的细菌不能用现有的培养方法获得[4-5].随着非培养技术、宏基因组测序技术的进步,微生态的研究进入了一个全新的阶段。