WLL-1株博卡病毒(Bocavirus)基因组测序及生物信息学分析

来源 :浙江检验医学 | 被引量 : 0次 | 上传用户：ajimide001

【摘要】

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目的对分离的人博卡病毒WLL-1株进行全基因组测序和生物信息学分析。方法运用NCBI提供的blastp分析各编码蛋白质的同源性;用SIB提供的ProtParam和ScanProsite推测计算蛋白质

【作者】

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林峰曾爱平杨恩林海燕郑昌华陈弘李桦李旭阳郁明

【机构】

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温岭市第一人民医院,杭州致远医学检验所,军事医学科学院放射与辐射医学研究所

【出处】

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浙江检验医学

【发表日期】

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2007年1期

【关键词】

：

人博卡病毒基因组测序生物信息学分析

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目的对分离的人博卡病毒WLL-1株进行全基因组测序和生物信息学分析。方法运用NCBI提供的blastp分析各编码蛋白质的同源性;用SIB提供的ProtParam和ScanProsite推测计算蛋白质的各种物理特性参数。蛋白进行结构域分析采用SIB提供的ScanProsite。对具有同源序列和无同源序列的蛋白分别采用SwissProt和Scratch Protein Predictor预测其三级结构。蛋白质功能分析采用CBS Prediction Servers提供的ProtFun软件。结果WLL-1病毒株

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