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根据战略性新兴产业自主技术创新能力的形成路径，提炼出资源投入能力、执行能力、产出能力以及环境支撑能力四个测量维度，依此构建了战略性新兴产业自主技术创新能力评价指标体系。在综合运用层次分析法和熵值法组合赋权基础上，根据物元可拓集合理论建立多级优度评价模型和评价方法。以湖南省医药制造业统计数据为例进行了评价，结果表明，该模型和评价方法具有较好的适用性，能为战略性新兴产业自主技术创新能力的评价和培育提供决策参考。