A study of DNA bases sequence preference of aclarubicin B to bind DNA and inhibit DNA

来源 :中国抗生素杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ddd12322
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采用荧光淬灭法和体外无细胞RNA合成系统研究了阿柔比星B结合DNA和抑制DNA依赖性RNA合成的DNA碱基顺序选择性。结果表明阿柔比星B与小牛胸腺DNA,poly[d(A-T)]和poly[d(G-C)]有明显结合;结合RNA的活性小;与天然DNA的结合力较与变性DNA的结合力大。Scatchar分析显示阿柔比星B结合3种DNA的亲和性依次为poly[d(A-T)]>poly[d(G-C)]>小牛胸腺DNA。同样,用大肠杆菌RNA多聚酶和大鼠肝细胞核游离RNA多聚酶实验均显示阿柔比星B的抑制力依次为poly[d(A-T)]>poly[d(G-C)]>poly[d(I-C)]。上述结果证明抑制RNA合成的碱基顺序选择性与其结合DNA碱基顺序的选择性有关 Fluorescence quenching and in vitro cell-free RNA synthesis were used to study the DNA base sequence selectivity of aclarubicin B binding to DNA and inhibition of DNA-dependent RNA synthesis. The results showed that aclarubicin B had obvious binding to calf thymus DNA, poly [d (A-T)] and poly [d (G-C)]; the activity of binding RNA was small; Denaturation of DNA binding. Scatchar analysis showed that the affinabacterin B binding to the three DNAs was in the order of poly [d (A-T)]> poly [d (G-C)]> calf thymus DNA. Similarly, both RNA polymerase and rat liver nuclear RNA polymerase showed that the inhibitory potency of aclarubicin B was poly [d (A-T)]> poly [d (G-C) d (I-C)]. The above results demonstrate that the base sequence selectivity that inhibits RNA synthesis is related to its selectivity for binding to DNA base sequences
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