【摘 要】
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采用Illumina HiseqTM分别对黏虫取食的玉米叶片及对照组材料进行转录组测序,鉴定和分析响应黏虫取食基因的可变剪接事件。结果表明,对照组中鉴定出15701个基因对应79363个可
【机 构】
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山西师范大学生命科学学院,山西省农业科学院作物科学研究所
【基金项目】
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山西省重点研发计划项目(201703D221001-2),山西省重点研发计划项目(201703D221001-4)
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采用Illumina HiseqTM分别对黏虫取食的玉米叶片及对照组材料进行转录组测序,鉴定和分析响应黏虫取食基因的可变剪接事件。结果表明,对照组中鉴定出15701个基因对应79363个可变剪接事件,黏虫取食组中鉴定到11791个基因的39385个可变剪接事件。2组玉米基因组在不同的可变剪接类型中,均是以第1个外显子可变剪切、最后1个外显子可变剪切、单内含子滞留和可变5′或3′端剪切4种类型为主。对2组发生可变剪接事件的基因进行比对发现,黏虫处理组新增加了1121个可变剪接基因,差异表达分析鉴定出177个
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