为了研究波纹唇鱼对热应激效应的基因表达差异,运用高通量RNA-seq技术对波纹唇鱼热应激和常温条件进行了转录组测序。首先分别提取30℃热应激处理和25℃常温条件下波纹唇鱼总RNA,以Illumina hiseq2000平台进行RNA-seq分析,利用Fastx-toolkit pipeline去除低质量reads。Cufflinks software用于组装转录本,并鉴定对照组和热应激组之间的差异表达基因。2个对照组样品分别获得20622887和20670622对高质量reads,热应激组的2个样品分别获得20708069和20701261对高质量reads。DEGs鉴定结果表明1655个基因受热应激诱导差异表达。GO富集分析显示,表达上调的基因包括MCM、DNA复制起始等与细胞组成和生物过程相关的基因;而表达下调基因主要集中于ERK等机体免疫应答相关因子。实验结果表明,热应激导致波纹唇鱼免疫应答相关基因的下调,可能导致其免疫应答功能下降。波纹唇鱼在热应激条件下的免疫功能下降,可能是导致死亡的原因,这为进一步提升波纹唇鱼资源保护和人工养殖技术提供理论支持。