【摘 要】
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目的 探讨分析骨质疏松患者基因多态性与椎间盘退变的相关性研究.方法 通过GEO数据库获取骨质疏松症(osteoporosis,OP)与椎间盘退变(intervertebral disc degenerative,IDD)的基因表达谱数据,分析两者的差异基因并取交集,再利用Cytoscape软件构建PPI网络,根据度值筛选出关键基因,并分析其与OP和IDD之间的关系.最后利用DAVID数据库分析关键基因在OP和IDD发生发展过程中的主要生物功能和信号通路.结果 在OP与IDD的发生发展中共有205个交集基因
【机 构】
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江西中医药大学,江西 南昌330004;广西中医药大学,广西 南宁530000
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目的 探讨分析骨质疏松患者基因多态性与椎间盘退变的相关性研究.方法 通过GEO数据库获取骨质疏松症(osteoporosis,OP)与椎间盘退变(intervertebral disc degenerative,IDD)的基因表达谱数据,分析两者的差异基因并取交集,再利用Cytoscape软件构建PPI网络,根据度值筛选出关键基因,并分析其与OP和IDD之间的关系.最后利用DAVID数据库分析关键基因在OP和IDD发生发展过程中的主要生物功能和信号通路.结果 在OP与IDD的发生发展中共有205个交集基因,其中UBC、YWHAZ、TP53、CUL3、NTRK1、BRCA1、Mcm2、ESR1为关键基因.GO功能分析与KEGG富集分析结果显示,与OP和IDD的发生发展过程密切相关的生物学过程主要涉及蛋白质-DNA复合物组合、蛋白质-DNA复合物亚基组织、蛋白质去泛素化、蛋白质小分子修饰、染色体组织的调控等,主要涉及PI3K/Akt信号通路、泛素介导的蛋白质水解、线粒体自噬、影响细胞周期及凋亡相关通路、神经营养素信号通路、甲状腺激素信号通路等.结论 OP与IDD之间存在着高度重合的差异基因表达,所涉及的基因功能和信号通路有助于了解两种疾病共同的发病机制,并为药物研发及治疗方式提供一定的参考.
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