【摘 要】
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RING型泛素连接酶（RING finger protein,RFP）在植物响应非生物胁迫中有着重要作用。本研究在马铃薯干旱胁迫相关转录组测序的基础上,利用RT-PCR技术从马铃薯栽培品种"大西洋"和
【基金项目】
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国家自然科学基金项目(31460370;31660416);甘肃农业大学“伏羲杰出人才培育计划”项目(FXRC20130-102)共同资助
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RING型泛素连接酶（RING finger protein,RFP）在植物响应非生物胁迫中有着重要作用。本研究在马铃薯干旱胁迫相关转录组测序的基础上,利用RT-PCR技术从马铃薯栽培品种"大西洋"和"青薯9号"中克隆得到StRFP2基因,并对该基因进行生物信息学分析。结果表明,该基因CDS为1 113 bp,且为连续基因,编码一个370个氨基酸的蛋白质。StRFP2蛋白不含信号肽序列,主要分布在线粒体;StRFP2蛋白含有典型的RING-H2保守结构域,并且"大西洋"和"青薯9号"的RING-H2保守结构域均未发生突变。栽培品种"大西洋"和"青薯9号"StRFP2 CDS序列高度同源,同源性达到98.20%;氨基酸序列进化分析表明StRFP2与野生番茄和番茄的亲缘关系最近。空间三维结构分析发现"大西洋"和"青薯9号"StRFP2均具有两个Zn2+,但其折叠方式存在一定差异。
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