【摘 要】
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为了解黄秋葵抗南方根结线虫相关基因组学,利用Illumina Hi-seq TM2500高通量测序技术研究受南方根结线虫侵染后黄秋葵种质12C2转录组基因的差异表达。结果表明,接种南方根结
【基金项目】
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福建省公益类科研院所专项(2018R1101025-2)
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为了解黄秋葵抗南方根结线虫相关基因组学,利用Illumina Hi-seq TM2500高通量测序技术研究受南方根结线虫侵染后黄秋葵种质12C2转录组基因的差异表达。结果表明,接种南方根结线虫18 h后,从接种和未接种的黄秋葵种质12C2根尖中共获得71.49 Gb有效数据,Q30碱基百分比均达到94.0%以上。共获得2318个差异表达基因(DEGs),包括1156个上调基因,1162个下调基因,其中功能注释基因2202个。根据unigene库序列进行GO、KOG和KEGG注释,细胞壁代谢相关基因——内切
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