基于染色体三维结构共调控域基因功的分析

来源 :基因组学与应用生物学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yzl1983523
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真核生物的染色质在细胞核中高度折叠且有序排列,这种三维结构对基因的转录、调控和表达等细胞进程具有重要的生物学意义.本研究基于酵母染色体三维结构模型,用3σ-准则筛选高分辨率Hi-C (high-throughput chromosome conformation capture,Hi-C)数据,对潜在的共调控区域进行搜索定位,并用简单的统计学方法分析了核小体占位率、组蛋白修饰、蛋白质置换水平、基因富集等影响因子在共调控区域TSS附近的分布特征,进而对共调控域基因功能与染色体结构之间的关系进行研究.结果 发现,以上影响因子在28个共调控区域中具有相似的分布特征和基因功能信息.由此推测,这些“共性''基因可能协同参与了基因调控,并驱动形成了染色体特定空间折叠结构.
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