基于生物信息学分析高表达RAI14对结肠癌及其耐药性的影响

来源 :沈阳药科大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hasfyturnip
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目的 研究维甲酸诱导蛋白14(retinoic acid induced 14,RAI14)与结肠癌及其耐药性之间的关系。方法 运用Oncomine、UALCAN、HPA数据库分析RAI14在正常结肠组织与结肠癌组织中的表达差异;PrognoScan联合HPA数据库分析RAI14表达量与结肠癌患者预后的相关性;GEO数据库分析RAI14在结肠癌化疗耐药性细胞系中的表达量;CTRP数据库分析大肠肿瘤细胞系RAI14表达量与化学小分子敏感性的相关性;TargetScan联合UCSC Xena分析RAI14与hsa-miR-183的相关性;GEO数据库分析hsa-miR-183在结肠癌和耐药性结肠癌细胞系中的表达;COREMINE分析RAI14、hsa-miR-183、结肠癌、耐药性及其生物过程的相关性。结果 RAI14在结肠癌组织中高表达,而且与结肠癌患者不良预后显著相关。化疗耐药的结肠癌细胞系中RAI14表达量也显著高于对化疗药物敏感的结肠癌细胞系,RAI14基因表达量与大肠肿瘤细胞系对化学小分子的敏感性负相关。hsa-miR-183靶向于RAI14保守序列,并且结肠癌组织的MIR183基因拷贝量与RAI14表达量负相关。hsa-miR-183在结肠癌及耐药性细胞系中低表达,文本挖掘显示hsa-miR-183与结肠癌耐药性显著相关。结论 高表达RAI14与结肠癌及其耐药性显著相关,并且可能通过hsa-miR-183转录后调控实现。
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