【摘 要】
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含C1q结构域蛋白(C1q domain containing,C1qDC)是经典补体途径的起始分子,能够识别免疫复合物,启动补体系统经典途径.本研究基于马氏珠母贝(Pinctada fucata)全基因组测序数据,结合生物信息学方法对C1qDC基因进行了鉴定,同时对其系统进化关系、序列结构、基序组成、染色体定位和基因家族成员的表达水平进行了分析.结果显示,从马氏珠母贝全基因组数据中共鉴定出285个C1qDC基因;根据系统进化关系聚集为5个亚类,不均匀分布在14条染色体上;所有C1qDC序列均含有保守基序
【机 构】
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广东海洋大学水产学院,广东湛江524088
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含C1q结构域蛋白(C1q domain containing,C1qDC)是经典补体途径的起始分子,能够识别免疫复合物,启动补体系统经典途径.本研究基于马氏珠母贝(Pinctada fucata)全基因组测序数据,结合生物信息学方法对C1qDC基因进行了鉴定,同时对其系统进化关系、序列结构、基序组成、染色体定位和基因家族成员的表达水平进行了分析.结果显示,从马氏珠母贝全基因组数据中共鉴定出285个C1qDC基因;根据系统进化关系聚集为5个亚类,不均匀分布在14条染色体上;所有C1qDC序列均含有保守基序1.比较转录组数据分析显示,在溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)攻毒4 h后,马氏珠母贝C1qDC基因家族中有56个基因在血细胞中的表达水平发生了显著变化.其中,上调表达基因32个,下调表达基因24个.实时荧光定量PCR检测结果表明,随机挑选的8个C1qDC基因的表达模式与转录组数据一致.本研究结果为进一步解析马氏珠母贝C1qDC基因的进化模式及其在贝类免疫应答中的调控作用提供了理论基础.
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