人类基因同义密码子偏好的特征以及与基因GC含量的关系

来源 :生物化学与生物物理进展 | 被引量 : 0次 | 上传用户：ChinaKing1

【摘要】

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对人类的728个基因,按其编码区中GC的含量分成四组(从GC＜0.43到GC＞0.58),分别考察了这四组样本对同义密码子偏好的特征,发现在全部样本中都呈现NTG(N代表四种碱基中的任一种)特

【作者】

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石秀凡黄京飞柳树群刘次全

【机构】

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中国科学院昆明动物研究所

【出处】

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生物化学与生物物理进展

【发表日期】

：

2004年期

【关键词】

：

密码子偏好同义密码子人类基因 C结尾密码子 NTG密码子

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对人类的728个基因,按其编码区中GC的含量分成四组(从GC＜0.43到GC＞0.58),分别考察了这四组样本对同义密码子偏好的特征,发现在全部样本中都呈现NTG(N代表四种碱基中的任一种)特受偏爱和NCG尽量避免的特征.基因环境中GC含量与C3/G3含量(密码子第三位C和G的含量)的相关分析,以及四组样本对密码子的偏好都支持以C结尾的密码子在编码中有特殊的优势,这种优势有利于保证翻译的准确性.还考察了各种氨基酸含量随编码区GC含量不同而变化的趋势.

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