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高校是行政权力与学术权力并存的学术组织。目前，高校行政权力与学术权力之间缺乏协调性，集中表现为一个冲突与四个失位。冲突，即价值观念对立导致的冲突。失位，即行政权力越位、制度建立错位、制度建设理论基础缺位、科层组织行政本位。二者关系的理想追求应为行政权力与学术权力适度的张力与耦合。二元权力间要坚守权力有限与有限理性的原则，相互信任的原则，互为补充、互为促进的原则。