【摘 要】
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根据GenBank和ICB数据库中gyrB蛋白氨基酸序列的两个保守区域TPGMYIG和QRY(F)KGLGEM设计简并引物,以L.ferriphilum菌株YSK基因组DNA为模板,PCR扩增出获得大小约为2.2kb的DNA
【机 构】
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湖南科技大学生命科学学院,中南大学资源加工与生物工程学院
【基金项目】
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国家重大基础研究计划973项目;
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根据GenBank和ICB数据库中gyrB蛋白氨基酸序列的两个保守区域TPGMYIG和QRY(F)KGLGEM设计简并引物,以L.ferriphilum菌株YSK基因组DNA为模板,PCR扩增出获得大小约为2.2kb的DNA片段.序列分析表明,菌株YSK的扩增片断的开放阅读框(ORF)能够推导出一个编码分子量约为82.24 kD、氨基酸数目为731个的蛋白质片断.这个氨基酸序列与所研究的gyrB蛋白氨基酸序列显示出高度的同源性,尤其是与菌株AMC_Cont91的gyrB蛋白氨基酸序列的相似性高达92%,而与M.xanthus的gyrB的相似性最低,仅为37%.基于氨基酸序列的同源性及其所预测的蛋白质大小,可以推断出该扩增片段属于gyrB基因.
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