【摘 要】
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SSR标记具有多态性高、重复性好、共显性等特点,易被用来开发高效简单实用的分子标记.为了丰富栽培种西番莲分子标记的种类和数量,本研究利用生物信息学方法对栽培种西番莲基
【机 构】
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广西农业科学院生物技术研究所,南宁,530007
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SSR标记具有多态性高、重复性好、共显性等特点,易被用来开发高效简单实用的分子标记.为了丰富栽培种西番莲分子标记的种类和数量,本研究利用生物信息学方法对栽培种西番莲基因组中的完全型SSR进行高通量鉴定,获得13 104个完全型SSR.SSR核心序列结构主要为2~4个碱基,数量最多的为TA、AT、TC和AG,重复次数最高达到20次.利用生物信息学软件开发出12 934对SSR标记,并选取了其中20对标记在西番莲MTX与WJ10中进行了扩增特异性评估,结果显示多态率达60%.西番莲栽培种SSR标记的大量开发为西番莲种质资源的高效利用、品种的遗传改良及分子育种提供了技术支持.
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