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FASTTCP传输延时的估计是一个有待解决的问题。针对这些开放性问题,根据FASTTCP的单向加速应用特点,本文提出了一种新的传输层两层算法。一个活动的FASTTCP流的历史信息,如启动时间、运行时间等,在底层被记录下来。当新的FASTTCP流到达时,上层算法可以根据最早的FASTTCP流提供瓶颈链路的当前队列延时。传播延时的计算是以当前估测的最小往返延时与传播延时之差作为瓶颈链路的排队延时。最后,NS-2仿真结果验证了改进的两层算法的有效性。