杏褪绿卷叶植原体新疆分离物16S rDNA基因克隆与序列分析

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利用植原体16S rDNA基因通用引物对新疆轮台县疑似杏褪绿卷叶病植株总DNA进行巢氏PCR检测,扩增出大小约1.2 kb的特异性条带.对扩增产物克隆和测序,确定特异片段大小为1 248 bp.序列同源性比较和系统进化分析表明,新疆杏褪绿卷叶植原体不同分离株16S rDNA基因序列同源性极高,达到99.8%~100%.与16SrV组成员的同源性达到98.2%以上,其中与16SrV-B亚组的枣疯病植原体山东宝山分离株,甜樱桃绿化植原体山东分离株同源性最高,达到99.4%~99.6%.进一步虚拟RFLP分析,结果表明该植原体属于榆树黄化组(16SrV)的一个新的亚组,与其相似性最高的是16SrV-B亚组,相似系数为0.94.本研究首次报道了新疆杏褪绿卷叶植原体16S rDNA的序列,确定了其分类地位,为杏褪绿卷叶病的早期诊断和检测提供了基础.
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