【摘 要】
：
[目的] 构建和比较抗结核杆菌药物虚拟筛选模型，助力抗结核药物的研发。[方法]本研究提出一种基于课程式学习优化的图神经网络模型GNN-MTB，用于抗结核杆菌抑制剂的虚拟筛选。进一步，从开放数据库中收集整理抗结核杆菌药物筛选相关基准数据集，将GNN-MTB与四种常规机器学习模型和两种图神经网络模型在基准数据集上进行性能比较。[结果] 在包含10，789条抗结核杆菌药物虚拟筛选实验数据中的分析结果
【机 构】
：
中国医学科学院/北京协和医学院医学信息研究所
【基金项目】
：
中国医学科学院医学与健康科技创新工程（项目编号：2021-I2M-1-056，2018-I2M-AI-016）； 国家自然科学基金（项目编号：81601573）； 国家重点研发计划（项目编号：2016YFC0901901）的研究成果之一；
论文部分内容阅读
[目的] 构建和比较抗结核杆菌药物虚拟筛选模型，助力抗结核药物的研发。[方法]本研究提出一种基于课程式学习优化的图神经网络模型GNN-MTB，用于抗结核杆菌抑制剂的虚拟筛选。进一步，从开放数据库中收集整理抗结核杆菌药物筛选相关基准数据集，将GNN-MTB与四种常规机器学习模型和两种图神经网络模型在基准数据集上进行性能比较。[结果] 在包含10，789条抗结核杆菌药物虚拟筛选实验数据中的分析结果显示，GNN-MTB模型的预测性能（AUC：0.912，AUPR: 0.679）优于传统的机器学习模型和图神经网络模型的性能表现（平均AUC：0.878-0.900，平均AUPR：0.600-0.673），平均AUC和AUPR的最大提升幅度达3.87%和13.17%。同时，本研究开源GNN-MTB模型并构建了抗结核杆菌药物虚拟筛选预测工具以供广大抗结核杆菌药物研究者使用（https://github.com/gu-yaowen/GNN-MTB）。[局限] 抗结核杆菌药物虚拟筛选模型建模可进一步纳入药物敏感性和菌株耐药性相关分析。[结论] 本研究提出的抗结核杆菌药物虚拟筛选模型GNN-MTB取得了良好性能，可进一步探索将其应用于抗结核病药物研发。同时，本研究框架也可为其它疾病药物的虚拟筛选提供参考。
其他文献
针对中国提出2030年实现“碳达峰”的目标，作为处于工业化中期的内陆省份，安徽省面临着巨大的减碳压力。分析了安徽省2015—2019年碳排放总量和排放强度变化，对安徽省碳排放现状进行了分析讨论，并以2019年为基准年，依据对数平均迪氏指数法（LMDI）分解模型预测了基准情景、柔性低碳情景和刚性低碳情景下安徽省2020—2035年碳排放量。最后，针对安徽省实现2030年“碳达峰”所面临的问题，从多方
Loss-cone instabilities are studied for linear fusion devices. The gyro-kinetic equation for such a configuration is rigorously constructed in terms of action-angle variables by making use of canonica
文化是民族历史的根基，是人类赖以生存的精神家园。中华文化历史悠久，博大精深，有着突出的价值，承载着中华民族记忆，彰显着中国人民独特的精神特质。在文化自信视域下，对中华优秀传统文化进行传承和发展，能够助力文化强国战略得以实施。文章围绕文化自信视域下中华优秀传统文化的传承与发展情况进行分析，促进中华优秀传统文化实现深度传承发展。
分子筛胶囊催化剂被广泛应用于串联催化反应中.与多步反应相比,串联反应具有更高的化学反应效率,能节约反应时间和原料,并实现反应物到目的产物的一步转化.然而,目前普遍采用的物理混合型催化剂,很难高选择性的生成目的产物.分子筛膜包裹的核-壳型胶囊催化剂由于其特殊的结构形式,在许多串联反应中可以一步高选择性的生成目的产物.如:合成气选择性制异构烷烃,合成气直接制二甲醚,合成气直接制液化石油气等重要多相催化
目前，我国高校图书馆陆续入驻各种网络视频平台，视频营销成为图书馆服务营销的主要方式之一。通过对我国高校图书馆在bilibili平台营销运营情况的调查，结合“现代营销学之父”菲利普·科特勒提出的CCDVTP模型，从目标用户、创新、沟通、价值传递和获利等方面对高校图书馆视频营销现状进行了分析，提出了高校图书馆在网络视频平台的营销策略。
幼儿自主游戏有多样的游戏设计和多元的游戏风格,融合教师的点拨,可以更好地启发幼儿理解社会,提高其社会适应性。幼儿的自主游戏以幼儿的自我体验和自我实践为先决条件。幼儿在自主参与游戏中,可以融合自己的想象,进行一定的角色理解。同时,幼儿还可以通过多种多样的道具,提升自己的审美能力。教师要在幼儿自主游戏中加入多样的社会因素,更好地发展幼儿的多重社会适应性。
幼儿时期的孩子是极为特殊的教育对象。游戏是一种广受幼儿喜欢和容易接受的一种教育方式,这种教育方式非常契合幼儿的生理、心理以及行为特征,将其融入到幼儿教育当中,可以有效的调动幼儿学习的积极性,提高幼儿的学习、交流能力。本人通过分析和研究游戏在幼儿教育中的重要性,来阐述应用策略。
目的 探讨HV/AIDS患者结核分枝杆菌潜伏感染状况及影响因素，为开展结核病潜伏感染预防性干预提供依据。方法 2020年1月—2021年3月在南宁市第四人民医院确证为HIV感染且未患结核的患者为研究对象，进行γ-干扰素释放试验，结核杆菌潜伏感染（LTBI）者为观察组，单纯HIV/AIDS患者为对照组，调查分析流行病学特征并对潜伏感染的可能影响因素性别、年龄、民族、居住地、BMI、家庭人均月收入、基
传统文化中蕴含的宝贵精神和处世哲理，可以使大学生群体坚定理想信念、增强文化自信、抵制历史虚无、得到精神滋养。目前，教学形式刻板、教学材料不配套、教师能力参差不齐是影响大学生用传统文化坚定文化自信的主要因素，可通过建设合作体系，提升教师素养，借助新媒体平台创新课堂形式等措施推动大学生增强文化自信。
"天下兴亡,匹夫有责。"这是中国特有的价值观,也是历史给予广大群众的思想启迪。实现中华民族伟大复兴梦离不开具有社会责任意识的新时代建设者和接班人——青少年。在这样的时代背景下,培养学生社会责任感已经成为广大教师义不容辞的重任。文章以高中历史教学为例,借助情境教学法,打造充满"育人"价值的高中历史课堂,加强中学生社会责任感培养。