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1.一般贮藏：利用土窖、通风贮藏库、地下室、防空洞等阴凉场所进行贮藏，把番茄装在浅筐或木箱中平放于地面，或将果实堆放在菜架上，每层架放2～3层果。要经常检查，随时挑出已完熟果或不宜继续贮藏的果实。此法可贮20～30天。
2.气调贮藏：当温度较高或需长期贮藏时，宜采用气调贮藏。番茄气调垛的容量多为750kg～1000kg。由于番茄自然完熟速度很快，因此最好用快速降氧法。采用薄膜封闭番茄，须设法降低温度，目前较为普遍应用的是氯气，每2～3天施用一次，每次用量约为垛内空气体积的0.2%，但氯气有毒，过量易产生药害。北京等地试用0.5%的过氧乙酸，置盘中放在垛内。上海用漂白粉代替氯气，在1000kg的帐内每次施用0.5kg，有效期约10天。
番茄气调贮藏一般为1.5～2个月，不必太长。贮期小于45天，贮藏中不必开帐检查，入贮时须对果实严格挑选。
3.亚硫酸、石灰水溶液浸泡贮藏：将6%亚硫酸配成0.3%的水溶液，再用饱和石灰水的澄清液将PH值调至4～5.5，将全红番茄浸至该液中，用清洁木板等物压住果实，防止露出液面，使浸泡液高出果实2cm～3cm，然后密封容器，置于低温处。此法可贮存100天左右，好果率达95％，果实硬度与鲜果相近，但不能生食，须加热熟食方能除其硫味。
2.气调贮藏：当温度较高或需长期贮藏时，宜采用气调贮藏。番茄气调垛的容量多为750kg～1000kg。由于番茄自然完熟速度很快，因此最好用快速降氧法。采用薄膜封闭番茄，须设法降低温度，目前较为普遍应用的是氯气，每2～3天施用一次，每次用量约为垛内空气体积的0.2%，但氯气有毒，过量易产生药害。北京等地试用0.5%的过氧乙酸，置盘中放在垛内。上海用漂白粉代替氯气，在1000kg的帐内每次施用0.5kg，有效期约10天。
番茄气调贮藏一般为1.5～2个月，不必太长。贮期小于45天，贮藏中不必开帐检查，入贮时须对果实严格挑选。
3.亚硫酸、石灰水溶液浸泡贮藏：将6%亚硫酸配成0.3%的水溶液，再用饱和石灰水的澄清液将PH值调至4～5.5，将全红番茄浸至该液中，用清洁木板等物压住果实，防止露出液面，使浸泡液高出果实2cm～3cm，然后密封容器，置于低温处。此法可贮存100天左右，好果率达95％，果实硬度与鲜果相近，但不能生食，须加热熟食方能除其硫味。