细菌总RNA提取方法的比较

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采用改良前后的Trizol法,RNAiso plus法、Qiagen试剂盒法以及Triton X-100法,从大肠杆菌(Escherichiacoli),枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis),乳酸乳球菌(Lactococcuslactis)3株细菌中提取RNA。用琼脂糖凝胶电泳和核酸浓度测定仪检测总RNA的提取质量,并用RT-PCR(ReverseTranscription Polymerase Chain Reaction)对RNA的质量进行验证。结果表明:RNAiso plus法对3株菌的总RNA提取均有很好的效果。Trizol法和Qiagen试剂盒法对于E.coli总RNA的提取效果不错,但对其他2株菌的提取效果均不明显,并且都伴有DNA污染。上述几种方法提取出的RNA样品中均含有23S和16S rRNA。L.lactis更适合用Triton X-100法提取总RNA。改良后的Trizol法和RNAiso plus法与Triton X-100法的原理基本相同,都是采用加热的方法,更彻底地裂解细菌细胞,而且得到的RNA中不含有rRNA和tRNA,只保留了mRNA,能更好地用于后续的实验研究。
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