甘蔗MAP激酶基因SoMAPK克隆与生物信息学分析

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【目的】克隆甘蔗MAP激酶家族新基因的全长序列,为了解甘蔗抗逆胁迫机制提供依据。【方法】以新台糖22为材料,提取甘蔗幼叶总RNA并反转录为cDNA;利用已知物种MAP激酶基因核苷酸序列保守区设计引物,采用5’和3’端RACE技术克隆新基因全长,并进行生物信息学分析。【结果】克隆获得的甘蔗新基因与玉米ZmMAPK4同源性很高,达92.6%,将该基因命名为soMAPK4(登录号JQ062930),基因全长1499bp,其中开放阅读框(0RF)为1128bP,5’非翻译区(UTR)为218bp,3’非翻译区(U
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