目的研究叶绿体trn L-F和rpoC1基因序列在当归及其混伪品间的分子鉴定作用,建立其分子鉴别方法。方法对25份当归及其混伪品材料的trnL-F和rpoC1序列进行扩增、测序。对序列进行比对、分析,计算材料间的遗传距离并构建系统进化树。结果 trnL-F序列在长度变化范围,变异位点和信息位点个数及遗传距离变异幅度上均大于rpoC1序列。trnL-F序列数据显示,当归及其混伪品材料具有显著碱基差别,具有1个特异鉴别SNP位点和1个A碱基重复的特异鉴别区域。当归与混伪品间遗传距离在0.002~0.231之间。通过trnL-F序列重建的系统发育树能将当归与混伪品有效地区分开。rpoC1序列比对结果无法找出当归及其混伪品间的差异位点,同时其构建系统进化树也无法区别当归及其混伪品。结论 rpoC1序列对当归及其混伪品间的鉴别作用不佳,而trnL-F序列能成功鉴定当归及其混伪品,可作为当归及混伪品的分子鉴定方法。