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大豆HMGR基因家族的鉴定与表达分析

来源 :山西农业大学学报(自然科学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户：a5b4123

【摘 要】

：

[目的]3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGR)是大豆皂苷合成途径的关键酶之一。从全基因组水平鉴定大豆 HMGR 基因家族并进行生物信息学和表达模式分析,为研究和利用大豆 HM

【作 者】

：

刁秀楠  斛如媛  高春艳  张永坡  王敏  杜维俊  赵 

【机 构】

：

山西农业大学文理学院,山西农业大学林学院,山西农业大学农学院

【出 处】

：

山西农业大学学报(自然科学版)

【发表日期】

：

2019年4期

【关键词】

：

大豆 HMGR基因家族 生物信息学 表达分析 

【基金项目】

：

山西省重点研发计划项目(201703D221004-5,201703D211001,201803D221020-2);山西省自然科学基金(2016011076);山西农业大学科技创新基金项目(zdpy201706);国家级大学生创新创业训练计划项目(201810113004)

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[目的]3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGR)是大豆皂苷合成途径的关键酶之一。从全基因组水平鉴定大豆 HMGR 基因家族并进行生物信息学和表达模式分析,为研究和利用大豆 HMGR 基因家族生物学功能奠定基础。[方法]根据Pfam数据库中 HMGR 基因的保守结构域(编号PF00368),利用HMMER3.0、PFAM和SMART软件鉴定大豆基因组中的 HMGR 基因。采用ProtParam等软件对其基因和蛋白序列进行生物信息学分析。利用qRT-PCR方法分析 GmHMGR 基因在苗期根、茎、叶等

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