全基因组预测幽门螺杆菌的分泌蛋白

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目的 运用生物信息学方法预测幽门螺杆菌分泌蛋白,为后续研究奠定基础。方法 用Signalp和TMHMM两个软件对幽门螺杆菌全基因组开放读码框(ORFs)进行预测,Microsoft Access数据库分析处理以识别分泌蛋白,再与Hp NCTC 26695二维凝胶电泳质谱鉴定蛋白质组数据库(2DE-MS)和免疫蛋白质组研究结果进行比对验证。结果 从Hp的1587个编码蛋白的ORFs中预测出191种分泌蛋白,其中27个预测蛋白与二维凝胶电泳质谱鉴定(2DE-MS)的Hp蛋白数据库中的蛋白一致;13个预测蛋白出
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