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合成肽库由含特定长度的肽片段所组成，它包含了该长度短肽的各种可能序列或绝大部分序列。合成肽库家族包括随机合成肽库、合成肽组合文库（ＳＰＣＬ）、多用途肽库（ＭＵＰＬ）、位置扫描合成肽组合文库（ＰＳ－ＳＰＣＬ）、寡核苷酸编码的合成肽库等。肽库技术除可用于蛋白质研究及分子识别，也开始应用于免疫学领域，如抗原表位分析、药物设计及疫苗研制等方面。