【摘 要】
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目的 探索ALDH2对肝细胞肝癌的诊断以及预后价值.方法 从TCGA数据库下载关于泛癌的RNAseq的样本数据,分析不同肿瘤组织与相应的正常组织中ALDH2的差异表达,然后分别通过TIMER2.0及GEPIA数据库分析泛癌中ALDH2的表达.从TCGA数据库下载有关肝细胞肝癌的配对样本,所有的样本均包含有分期、预后、一般资料等临床信息,对肝细胞肝癌与正常组织中ALDH2基因的表达值进行差异分析.根据每个样本ALDH2基因的表达值、是肝细胞肝癌组织还是正常组织,构建出预测样本属于肝细胞肝癌还是正常组织的RO
【机 构】
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河南省人民医院麻醉与围术期医学科,郑州大学人民医院,郑州450003
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目的 探索ALDH2对肝细胞肝癌的诊断以及预后价值.方法 从TCGA数据库下载关于泛癌的RNAseq的样本数据,分析不同肿瘤组织与相应的正常组织中ALDH2的差异表达,然后分别通过TIMER2.0及GEPIA数据库分析泛癌中ALDH2的表达.从TCGA数据库下载有关肝细胞肝癌的配对样本,所有的样本均包含有分期、预后、一般资料等临床信息,对肝细胞肝癌与正常组织中ALDH2基因的表达值进行差异分析.根据每个样本ALDH2基因的表达值、是肝细胞肝癌组织还是正常组织,构建出预测样本属于肝细胞肝癌还是正常组织的ROC曲线.根据高低二分类法,将所有样本分为ALDH2高表达组与低表达组,构建二分类Logistics回归模型,分析ALDH2的表达值高低是否与肝细胞肝癌的不同肿瘤分期具有相关性.根据中位数分法将ALDH2分为高表达组与低表达组,分析ALDH2的高表达或低表达对生存预后指标OS、DSS的影响.最后,构建了ALDH2与不同的临床特征以及临床结局的桑基图.结果 ALDH2在泛癌的大部分肿瘤类型中表达下调.无论是配对样本还是非配对样本,ALDH2在肝细胞肝癌中的基因表达值均较正常组织的表达值显著下降,组间样本间的差异具有统计学差异.ROC曲线的AUC面积、CI值显示ALDH2的表达值高低对肝细胞肝癌或是正常组织具有很好的预测作用.ALDH2的表达值高低与肝细胞肝癌不同的T分期具有显著的相关性.与低表达ALDH2的患者相比,高表达ALDH2的患者具有更好的OS与DSS.结论 ALDH2可以作为肝细胞肝癌的潜在诊断及预后指标.
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